Ďalší obojsmerný účinok kortizolu je to, že ovplyvňuje hlavné metabolické spaľovanie tukov motora tela, štítnej žľazy. Tak nízka hladina kortizolu môže tiež viesť k nízkej aktivite štítnej žľazy. Vysoký kortizol blokuje normálnu premenu neaktívnej štítnej žľazy ( T4 ) na aktívnu štítnej žľazu ( T3 ) .